Hija del gran productor Elías Querejeta, estudió Historia Antigua en la Universidad Complutense de Madrid. Debutó en el mundo del cine como actriz cuando solo contaba 13 años en la película Las palabras de Max, de Emilio Martínez Lázaro. Poco a poco fue pasando por todos los oficios del cine y en 1981 interviene como ayudante de dirección en Dulces horas, de de Carlos Saura. En 1988 fue ayudante de dirección y montaje de la serie 7 huellas, donde dirigió "Tres en la marca" que logró el Premio Teatro Arriaga en el Festival de Cortometrajes de Bilbao. En 1990 dirige junto a Jesús Ruiz y Nacho Pérez de la Paz, el documental El viaje del agua, premio Goya al mejor documental español. En 1992 dirige su primera película en solitario, Una estación de paso, premio especial del Jurado en la Semana de Cine de Valladolid. El último viaje de Robert Rylands (1996) le proporcionó el aplauso del crítica y público, pero fue Cuando vuelvas a mi lado, tres años después, la que le otorgó el de sus compañeros de profesión, que la homenajearon con siete nominaciones al Goya, incluida la de mejor película. Consagrada como una de las grandes de nuestro cine, sigue acumulando éxitos y elogios gracias a cintas como Héctor, Siete mesas de billar francés, 15 años y un día, Felices 140, Ola de crímenes o Invisibles, entre otras.